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微生物学与免疫学系.pdf

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复旦大学微生物学与免疫学系 研究生招生宣讲 改变世界的微生物 黄 广 华 2022年5月 特聘教授 执行主任 微生物为什么很重要? 病原微生物 细胞工厂 免疫与疫苗 微生物组 1. 微生物与人民健康和工农业密切相关; 2. 通过微生物,可以认识生命的本质; 3. 通过认识和改造微生物,可以改变世界。 微生物很重要, 但人类对微生物的认识非常有限! 微生物与基础科学研究 病毒 (1)微生物的基本生命过程与高等多细胞生物类似, 大部分基本分子细胞生物学知识是从研究微生物获得的; (2)微生物相对简单,容易研究和出成果; (3)有很多微生物学家获得过诺贝尔奖, 微生物学是科学的前沿。 微生物学 前景无限! 微生物与人类健康 雅典瘟疫 黑死病 天花 SAAS 病毒(公卫); 公共卫生安全 2. 细菌(耐药); 急性和慢性 3. 真菌(难治); 4. 其他,如寄生虫、疟原虫、血吸虫等。 1. 感染性疾病 微生物与人体免疫 1. 人类的历史充斥着与病原微生物 的斗争; 2. 免疫力是人类与病原微生物斗争的 武器; 3. 病原微生物与人体免疫共同进化, 如何打败 在动态中达成平衡。 病原微生物? 微生物与人体免疫 微生物与人体类的斗争从未停止过 划时代的免疫治疗 守护健康: 认识微生物,认识免疫系统 微生物与合成生物学 第一个人造生命 人造支原体 微生物的优势:“简单又不简单” 通过合成生命,认识和改造生命体 微生物的社会性:微生物群组 (microbiota) 发育,代谢,免疫,糖尿病, 肠道疾病, 炎症,心脏病, 神经系统疾病 天地不仁以万物为刍狗 有微生物,才有健康; 有微生物,才有多姿多彩的世界! 复旦大学 微生物学与免疫学系 • 国内第一批设立微生物学专业的高校 • 王鸣岐、李君璎、盛祖嘉等教授为我系的建设作出杰出贡献 • 在微生物学教学方面颇有声誉,多次获得全国教学成果奖和 优秀教材奖 历史源远流长 科研教学成果丰硕 大师辈出 微生物学与免疫学系 强大的人才队伍 系主任: 赵国屏院士 执行主任: 黄广华教授 正高:9人 副高:9人 人才计划:杰青2人、优青3人、青千3人 兼职/双聘:赵国屏 院士,张永振 教授 院士 杰青 杰青/优青 优青 优青 青千 青千 青千 …… 目前的主要研究方向 1 微生物与健康:        病毒、真菌和寄生虫致病机理及宿主互作 张永振(病毒的遗传、进化与生态) 胡薇(人类寄生生物) 王敬文(虫媒疾病的传播机制) 黄广华(病原真菌) 钟江(病毒的分子生物学及应用) 王吉鹏(寄生蠕虫防控) 张鹭(分枝杆菌致病分子机制) 2 合成生物学、环境微生物:  赵国屏/丁晓明(微生物基因组、合成生物学)  全哲学(微生物群落/生态) 3 肠道微生物与免疫、代谢调控  于肖飞(肿瘤、T细胞免疫、肠道微生物)  谢君(微生物感染与分子免疫) 赵国屏教授课题组 赵国屏,教授,博导,中国科学院院士。 1978-1982年,复旦大学生物系,学士; 1990年,美国Purdue大学生物化学博士; 2002年,国家自然科学二等奖; 2005年,国家科技进步二等奖; 2005年,何梁何利 “科学与技术进步奖”; 2015年,谈家桢生命科学奖 研究方向及背景 研究队伍及学生培养 课题组成员:赵国屏教授 副教授:丁晓明 吕亮东 在读博士研究生4人/硕士研究生3人 已培养博士后1人、博士14人/硕士11人 张永振教授课题组 张永振 职务:博士生导师,研究员;复旦大 学生命科学学院、表型组研究院、生 物医学研究院教授,复旦大学附属上 海公共卫生临床中心兼职教授 获奖:时代周刊 2020年“影响世界百 大人物”,2020年度Nature十大人物 招 生 需 求 态度积极端正,工作严谨踏实,具有高度的责任心和 良好的团队合作意识。倾向于走科研道路。 在 1.病毒生物学、分子生物学、进化生物学;2.病原 生物学、免疫学、传染病学;3.生物信息学、基因组学; 4.生态学 一个或多个方面,有一定的基础,并乐于学习 新的知识。 欢迎致信咨询、自荐! 联系人:陈老师(chenyanmei@shphc.org.cn) 地址:上海市淞沪路2005号 生科楼 D315 电话: 021-31246591,021-57249022 邮箱:zhangyongzhen@fudan.edu.cn ; zhangyongzhen@shphc.org.cn 探究病毒的多样性、遗传进化规律、生态传播规 律 代表性论文(*为通讯作者): 1. Guo WP, et al. Zhang YZ*. PLoS Pathogens. 2022 (Research Article). 建立病原预报系统,像天气预报一样预报疫情发 生 研究方向与成果: 研究病毒的遗传、进化及生态,探索病毒基因组的遗传进化、 病毒与宿主的相互作用关系及其在生命起源进化中的意义。课 3. Shi M, et al., Holmes EC, Zhang YZ*. Nature. 2018 (Research Article). 题组发现了2000余种全新病毒,是世界上发现新病毒最多的实 4. Shi M, et al., Holmes EC, Zhang YZ*. Nature. 2016 (Research Article). 验室,改变了世界对病毒学的认识。在2020年新冠疫情中率先 解析出新冠病毒基因序列,在后续新冠溯源问题中也作出了突 5. Li CX, et al., Holmes EC, Zhang YZ*. eLife. 2015 (Research Article). 6. Qin XQ, et al., Holmes EC, Zhang YZ*. PNAS. 2014 (Research Article). 出贡献。 2. Fan W, et al., Holmes EC, Zhang YZ*. Nature.2020 (Research Article) 钟江教授课题组 钟江 教授,博士生导师。复旦大学学士(1985) 和博士(1990)。曾获上海市优秀青年 教师奖(1999),上海市“曙光学者”(2001)。兼任上海市微生物学会副理事长。 研究方向:病毒分子生物学,主要研究内容包括:环境巨大病毒等新病毒的发现和生 物学意义,杆状病毒与宿主关系及病毒应用技术。 巨大病毒研究 Megavirus baoshan 基因组(1.2M) 800mm 首次在一株巨病毒基因组DNA两端发现有长达23kb的末端重复序列, 是病毒中已经报道的最长的序列,可能在病毒基因组复制中发挥作用 350mm 100mm 巨病毒Megavirus (基因组1.2Mbp) 马赛病毒 新冠病毒 (基因组350Kbp) (基因组30Kb) 近年,从环境中发现了许多种“巨大病毒”,它们在病毒中“鹤 立鸡群”,无论大小还是基因组长度都超过某些小型细菌。它们 主要以环境原声动物细胞为宿主,拥有特殊的基因组结构,编码 许多功能特殊的基因。它们在进化上的地位如何?在环境中有何 作用?对人有什么影响?还有多少环境病毒没有被发现? Mb0983 Mb0983 结构预测 Mb0983功能 在病毒编码的1000多个蛋白中,超20%属重复结构域蛋白,为多个保守 结构域串联形成。图中病毒编码的Mb0983蛋白由11个FNIP结构域和一 个N端Fbox结构域构成,它可以结合宿主Ras家族蛋白(Substrate),将 其引导进入细胞的泛素化降解系统,有利于病毒复制 全哲学教授课题组 全哲学 -微生物分子生态学实验室 (C305) 手机/微信:13381820256 E-mail: quanzx@fudan.edu.cn 来,一起追寻被“遗漏”的微生物 人体皮肤微生物组研究 全程硝化菌的富集培养 (国自然“水圈微生物”重大研究计划培育项目)     从2011年,一直与强生公司开展合作研究 与强生合作,初步认识到特定护肤品保护 皮肤免受空气污染时微生物组的作用机制 与表型组研究院合作,开展人体微生物组计划 参与科技部“健康人微生物组库和特征解析” 相关重点研发项目  全程硝化菌是2015年在Nature 首次报道的 新的硝化相关微生物类型  本实验室2014年已富集相关微生物  已富集和分离到特殊类型氨氧化菌  正研究其代谢机制和在生态系统中的贡献 2018年12月发表后已被SCI杂志引用70多次 评论文章  发表在皮肤病学领域top期刊J Inv Derm的文章, 有专门评论文章,被Faculty of 1000推荐 胡薇教授课题组 胡薇 博士生导师,国家杰出青年基金获得者(2017) 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所兼职研 究员(2012-至今) 复旦大学附属华山医院感染科双聘教授(2019-至今) huw@fudan.edu.cn 2020年3月起,援建内蒙古大学,任生命科学学院院长, 兼任省部共建草原家畜生殖调控与繁育国家重点实验 室主任。 从事寄生虫分子生物学、功能基因组及应用相关研究, 包括重要寄生生物的遗传变异、分子进化、发育、感 染过程及其与宿主的相互关系,并发展新的预防、诊 断和治疗方法,特别在日本血吸虫寄生与传播的分子 机理以及新型防控技术研发方面取得突出成绩。 先后承担国家自然科学基金、国家863计划、国家传染 病防治重大专项、国家重点研发计划等多项课题。 在 Nature、Nature Genetics、Nature Communications, Cell Reports等杂志发表SCI论文80余篇,获中国发明 专利授权9项,国家自然科学二等奖(第2完成人)。 日本血吸虫感染、生 入侵媒介生物 长发育和进化等生物 血吸虫病 适应性进化分子基础 学特性的分子基础 诊断/检测试剂的研发 日本血吸虫性成熟及产卵分子机制; 人兽共患传染病 日本血吸虫侵染终宿主相关分子及机制; 流行规律及病原监测 日本血吸虫遗传进化;日本血吸虫感染对宿主局部免疫调节作用; 人兽共患传染病 检测试剂的研发、 福寿螺、褐云玛瑙螺、双脐螺基因组解析; 疫苗研究 福寿螺、褐云玛瑙螺、双脐螺遗传多样性与适应性分子基础; 新疆边境地区蜱传重要传染病现况及流行趋势;内蒙古地区人兽共患病传播规律 日本血吸虫抗体快速诊断试剂的转化;曼氏血吸虫抗体快速诊断试剂的开发;日本血吸虫核酸快速检测技术; 包虫病检测试剂的研发;犬包虫病疫苗研究;田鼠巴贝虫诊断抗原筛选 陆艳,微生物与免疫学系,副研究员,硕士生导师 研究方向:病原与宿主的遗传多样性及共进化  解析病原/媒介的遗传变异及扩散规律  病原基因组及与宿主(人类)共进化研究  数据库建设(病原与媒介群体及组学数据库) 长期从事病原和宿主的遗传进化研究。发表SCI论文30余篇,近年来以第一作者或共同 通讯作者发表代表性论文10余篇,包括Cell Reports(2022)、Genome Biology (2017, 2019)、Molecular Biology and Evolution (2017)、American Journal of Human Genetics(2015)。入选上海市青年科技英才“扬帆计划” 。国家自然科学 基金青年项目负责人,作为项目骨干参与国家自然科学基金“微进化”重大研究计划 (重点项目)、国家自然科学基金“微进化”重大研究计划(集成项目)等重要项目的研究。 lueyan@fudan.edu.cn / luyan@picb.ac.cn 021-31246662 王吉鹏课题组 王吉鹏 青年研究员,博导。复旦大学博士 (2015),美国西南医学中心博后(2015-2021)。 以第一/共同一作在Cell 2022,Science 2020, Nature communications 2017 等期刊发表文章。 主要研究方向:以血吸虫为模型,研究寄生蠕虫 的发育、生殖、寄生及致病的分子机理,筛选新 型药物靶点及抗虫小分子抑制剂。 jipengwang@fudan.edu.cn 蠕虫:影响全球超20亿人! 王敬文研究员课题组 王敬文 研究员、博导 于肖飞课题组 于肖飞 青年研究员,博士生导师 2001-2005,复旦大学, 学士。 2005-2008,Iowa State University, 硕士。 2008-2014,UT Southwestern (HHMI), 博士。 2014-2019,Rockefeller University (HHMI), 博后。 2018,中组部青年千人 2020,上海千人 What You See Is What You Get: 生科院C323, xiaofei_yu@fudan.edu.cn 研究方向: 肠道T细胞免疫应答的近程 与远程调控作用 培养目标: 扎实的免疫学基础、良好 的学术与就业前景 论文发表: 谢君副教授课题组 谢君 副教授 朱乃硕 教授 研究助理:崔云霞,白豆 博士后:梁雨来, 博士生3人,硕士生3人 成立了复旦大学医学细胞康复校企联 合研究中心,项目经费3000万,主要 进行脐带干细胞和DC-CIK等免疫细 胞培养和诱导,探索其在糖尿病,高 血压,神经性疾病和肿瘤等重大复杂 疾病治疗方面的科技应用和理论研究。 基于基因组,表达组和表观组等多组学数据以及 临床数据等生物医药大数据的复杂疾病关键基因 和生物学路径的发现和实验验证。目的是发现复 杂疾病的驱动因子和细胞亚群,揭示复杂疾病的 发病机理并探索其在临床应用方面的前景。是大 数据分析和实验验证相结合的,从分子机理研究 到应用开发的整合应用系统生物学研究。 多价复合疫苗研究, 目前在肿瘤疫苗 ( 结 肠 癌 CT26 疫 苗 ) 、 抗 病 毒 疫 苗 (RSV疫苗)研究取得较好的进展,目 前已开发出PD-L分子阻断剂PPLC小分 子和免疫增效剂SBP。PPLC小分子已签 810万的转化合同。  2021年 复旦大学医学细胞康复校企联合研究中心, 3000万 ,到账经费400万  2019年 “高效技术抗肿瘤免疫分子PPLC发明成果及成药性技术”转让,合同转让费810万元,到位经费200万元  2019年 科技部国家重点研发计划项目:质子重离子新型放射治疗技术精准、实时评价技术研发 (2017YFC0107600)  2019年 指导研究生申报获得“云峰基金”一项;  2019年“高效炎症拮抗剂R632作为抗类风湿关节炎(RA)药的开发研究”成果获复旦张江研究院师生创新大奖赛“二等奖” 张鹭副教授课题组 张鹭博士,副教授,博导 学术指导与合作: 研究方向:细菌分子遗传学 刘军博士, zhanglu407@fudan.edu.cn,13524278762 多伦多大学分子免疫系, 终身教授 重大传染病专项连续支持 结核病细菌遗传学——基础应用研究 1. 科技部, 国家重点研发项目, 2021YFC2301500, 2021-12 至 2024-11 2. 科技部, 国家科技重大专项, 2017ZX10201301, 2017-01 至 2020-12 指导研究生: 博士:6人;硕士:10人 获奖情况: 国家奖学金:2人; 校级奖学金:5人 发表文章: • • • • • • • • • 海分枝杆菌-斑马鱼感染研究平台 人源化肺芯片研究平台 • • iScience. 2022 Microbiology Spectrum. 2022 Frontiers in Genetics. 2020 International Journal of Medical Microbiology 2020 Nucleic Acids Research. 2019. Virulence. 2018. Scientific Reports. 2017. Frontiers in Microbiology. 2017. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2017, 2017 Molecular Therapy. 2016. Scientific Reports. 2016. 黄广华教授课题组 黄广华 复旦大学特聘教授 国家杰青、优青 中国科学院“百人计划” 国家重点研发计划项目负责人 真菌是导致人类疾病的一类重要病原体。 我们重点研究: 人体病原性念珠菌的致病机理。 真菌与宿主互作机制。 超级真菌的鉴定和耐药机理。 课题组主要从事 真菌感染机理与新药开发研究 微生物学与免疫学系 未来学科发展规划 面向健康、工农业和国防等重大需求,建立一 只强大的微生物学研究队伍,服务国家重大需求 面向国家需求,面向科学前沿 在新发传染性疾病、结核、真菌病、寄生虫病、免疫和 病毒学等几个方向形成特色。 目标: 产出标志性成果(高影响力论文、重大技术成果); 培养一批人才; 面对国家重大需求时,能挺身而出,发出微生物系的声音。 复旦大学 微生物学与免疫学系 选择复旦微生物系的理由: 1 2 3 4 有大师,有大楼,还有美丽的校园; 有厚重的历史和文化的积淀,有美好的前景; 你可以在这快乐生活,快乐成长,出大成果! 你从这里起航…… 欢迎加盟复旦大学生科院 微生物学与免疫学系 不负韶华,未来可期! 你完全可以通过认识和改造微生物, 让世界更美好! 谢谢大家!

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