生态与进化生物学系.pdf

复旦大学生命科学学院 生态与进化生物学系 (生态学科) http://ecology.fudan.edu.cn • 生态学国家重点学科 • 教育部学科评估A类学科 • 双一流建设学科 • 生态学一流本科专业 • 主要研究平台与基地 – 生物多样性与生态工程教育部重点实验室(北师大共建)(2000) – 复旦大学-西藏大学生物多样性与全球变化联合实验室(2019) – 长江河口湿地生态系统国家野外科学观测研究站(2020) 总体定位  基础研究：以生物多样性科学为主干，以具国际影响的原创 成果为目标，开展生物多样性维持与保育的理论和应用研究  服务国家：结合国家及区域可持续发展的战略需求，开展应 用基础研究，为关键区域的生态安全与调控提供决策依据  人才培养：建成世界知名的生态学研究与人才培养高地 主要师资力量 • 教授/研究员：15人 • 青年研究员：4人 • 副教授：5人 • 实验岗位系列：7人 实验/教辅 23% 副教授 16% 青年研究员 13% 教授/研究员 48% 办公室/实验室面积约4500平方米 完备的高级人才培养体系 本科生 研究生 博士后 2013年通过教育部审核 2014年招生 2018年首批本科生毕业 生态学：一级学科博士点 科学硕士：生态学 专业硕士：生态工程(申 报) 生态学一级学科 博士后流动站 2012年建站，2013年启动 在读博士和硕士 研究生约120人 在站博士后约20人 在读本科生34人 每年大约招收本科生10人，硕士生15人，博士生15人 主要学术影响力 • 学科ESI排名位于生态与环境领域3.15‰ • 近五年： 主持国家重点研发计划、国家自然科学基金重点/面上/ 青年项目等国家级项目30余项 在Science, Nature Climate Change, Advanced Science, Nature Plants, Nature Communications, Ecology Letters, TREE, Current Biology等刊物发表论文300余篇 获国家科技进步奖1项，上海市自然科学一等奖1项，上 海市科技进步二等奖1项 2人为Elsevier“高被引学者”，20余人次担任SCI刊物 编委，10余人次担任国内学术刊物编委 20余人次在国内外学术组织任理事长、副理事长、理事 近年毕业研究生代表性成果 刘向 王新新 张珮 李金全 陈鸿洋 万年峰 Liu et al. PRSB, 10.1098/rspb.2016.2621 Liu et al. Ecology, 97: 1680-1689. Liu et al. New Phytologist, 221(3): 1574-1584. 获阳含熙院士生态学奖 Wang et al. Nature Communications, 11(1): 3471 Wang et al. Remote Sensing of Environment, 238: 110987. 高被引论文 Wang et al. ISPRS J of Photogrammetry and Remote Sensing, 163: 312-326. Zhang et al. Ecology Letters, 22(1): 200-210. 高被引论文 Zhang et al. Soil Biology & Biochemistry, 113: 231-239. F1000推介 Zhang et al. Ecosystems,21(3): 469-481. Li et al. Advanced Science, 7(19): 2001242. F1000推介 Li et al. Global Change Biology, 26(3): 1873-1885. Li et al. Soil Biology & Biochemistry, 141: 107675. Chen et al. Nature Communications, 11(1): 5733. F1000推介 Chen et al. Soil Biology & Biochemistry, 120: 24-27. Chen et al. Journal of Soils and Sediments, 10.1007/s11368-020-02767-0 Wan et al. Nature Plants, 10.1038/s41477-020-0654-y Wan et al. Elife, 10.7554/eLife.35103 Wan et al. Ecological Indicators, 10.1016/j.ecolind.2016.12.032 主要研究方向 I. 生物入侵与生态安全 II. 全球变化与生态系统响应 III. 生物多样性与生态系统服务 IV. 关键生态区动态与健康维持 海 长江流域 岸 带 主要研究区域 研究生招生专业：生态学 植物生态学，动物生态学，生态系统生态学， 进化生态学，全球变化生态学，土壤生态学， 生物多样性与保护生物学，景观生态学 代表性成果 I. 分子与进化生态学 “野生稻-栽培稻-杂草稻”复合体的适应性进化机制 环境因子：籼稻-粳稻形成 时空隔离：杂草稻遗传分化 野生稻通过人工驯化 形成不同类型的栽培稻 栽培稻经过去驯化过程 演化成不同类型的杂草稻 栽培稻基因渐 渗影响野生稻 演化 选择和基因渐渗 影响杂草稻演化 “野生稻-栽培稻-杂草稻”复合体 在New Phytologist, PNAS, Nature Communications, MBE 等生态领域权威期刊上发表系列 论文 被Nature的专门撰文评述，并被 Scientific American转载 植物分子生态学：资源植物生态适应性与保护 1)战略资源植物野生稻 的适应性进化机制与保 护策略 2)青藏高原资源资源植 物（红景天、青藏苔草、 紫花针茅）对全球气候 变化的响应 3)沉水植物 的性别分化 机制与生态 适应性 主持国家转基因重大专项课题、973项目子课题、自然科学等科研项目15项， 曾获教育部自然科学二等奖和上海市自然科学一等奖。 入侵生态学：互花米草入侵性形成的遗传与表观遗传基础 群体遗传结构 基因组组装 Reads Contig s Selection gene Scaffol d Selection gene Chromosom e Chinese USA 入侵地与原产地群体间表型差异 入侵地 原产地 原产地 入侵地 原产地 揭示互花米草适 应性表型性状形 成的分子机制,为 开展生物学防控 奠定基础 基因家族进化与功能, 基因复制与物种进化  基于分子系统发育学，结合古气候、多倍化事件、性 状转变、基因家族进化等多个角度揭示植物类群进化 历史，探讨其适应环境的策略与成为优势类群的过程  关注类群以植物大类群、經濟作物为主，包括：十字 花科、葫芦科、菊科、豆科、茄科、早熟禾稻亚科等 CH Huang, et al. CH Huang, et al. MBE, 2016 MBE, 2015 Yz Xiang, et al. MBE, 2017 Xp Qi, et al. MPE, 2018 CH Huang, et al., JIPB, 2019 J Guo, et al. MP, 2020 Yy Zhao, et al. MP, 2021 淡水浮游动物的分子系统发育与快速进化 Mol Phylogenet Evol 2019 浮游动物是淡水生态系统的关键组成，但我国淡水 浮游动物系统发生关系尚不明确 水蚤被NIH定为新的模式物种 杂种形成 隐种多样性 遗传多样性 物种分类学 Mol Ecol 2019 Limnol Oceanogr 2021 Limnol Oceanogr 2019 Contrib Zool 2021 动物应对环境变化的表观遗传调控机制 对环境变化的 快速响应 在与环境不同互作阶 段条件分段调控 可影响适应性进 化过程 提供了早期 响应证据 发现了寄主在不同感染阶段 的特异性表观遗传变异模式 揭示了表观遗传独立影响适 应性进化的能力 Mol Biol Evol 2019 Mol Ecol 2018 Genetics 2021 植物免疫与环境应答 高明君研究员 2006-2013 中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所 博士 2014-2021 英国剑桥大学Sainsbury实验室 博士后 2022-至今 复旦大学生命科学学院 青年研究员 研究方向：植物免疫与环境应答 通过遗传学、分子生物学、生物化学和细胞生物学等手段揭示植物抵抗病原菌的分子机理， 结合基因编辑和分子育种手段提高作物抗病能力，培育高抗高产品种，促进我国绿色农业和 绿色生态的发展。 代表性论文： Gao M et al (2021). Ca2+ sensor-mediated ROS scavenging suppresses rice intrinsic immunity and is exploited by a fungal effector. Cell 184(21):5391-5404. Gao M et al (2017). GDSL lipases modulate immunity through lipid homeostasis in rice. PLoS Pathogens 13(11): e1006724. 联系方式：E-mail: mjgao@fudan.edu.cn 代表性成果 II. 生物多样性与保护生物学 入侵生态学：种间关系与外来有害生物入侵  生物入侵：全球性五大环境问题之一，危及农林生产和生态安全  从物种间相互作用关系等角度，探讨人类活动和气候变化背景下生 物入侵的态势、机制与影响，探寻管理对策与防控技术 J Ecol 2020a 入侵植物互花米草治理工程 J Ecol 2020b; J Pest Sci 2020; Biol Invasions 2016, 2019 在Journal of Ecology、Journal of Applied Ecology 、 Journal of Pest Science、Biological Invasions等期 刊发表论文100余篇，编写地方 标准4项，获上海市科技进步二 等奖等省部级奖励10项 外来入侵植物的生态与进化 天敌释放 合作行为 植物-昆虫互作关系的进化 种内互作关系的进化 内容一 外来植物-昆虫互作关系的 地理分异与进化 内容二 外来植物种内互作关系 从竞争到互助的进化 互利共生 植物-土壤反馈效应的进化 内容三 外来植物-共生微生物互作关系的地理 分异与进化 内容四 外来植物互作关系对气候变化的 植物-微生物-昆虫三营养级互作关系在外来植物成功入侵中的作 响应与适应 用机制 聚焦国家生物安全重大需求，探讨外来植物入侵性的生态进化规律， 为外来有害生物控制提供科技支撑 New Phytologist 2021 Ecology 2021 Journal of Ecology 2019 互花米草入侵盐沼湿地的机制与生态系统影响 互花米草入侵 土著植物海三棱 昆虫、底牺动物鱼类 土壤理化特性和 水文条件改变 藨草、芦苇分布 生物多样性的组成和 面积急剧减小 丰度改变 适 栖 食 宜 息 食 源 栖 地 源 减 息 面 减 少 地 积 少 减 减 少 威胁水鸟及生态系统健康 少 全球最大的湿地入侵物种治理工程 互花米草生态控制核心技术：“六字方针” （围、割、淹、晒、种、调） 盐沼湿地生态系统及其功能退化 揭示了互花米草入侵的机制、生态 影响并提出科学控制对策，为上海 市政府提出了耗资10亿的互花米草 生态控制工程并得到采纳 2014年获得教育部自然科学二等奖 2019年获上海市自然科学一等奖 动物的种群生态学与保护生物学 方向1：濒危物种适应性机制 方向3：全程耦合框架开发 收集物种分布数据，识别关键栖息地和关 键走廊带，评估人类活动对于物种生存、 包括城市动物带来的影响。 识别不同尺度自然生态系统和社会经济系 统间的交互作用，分析复杂的自然-人类耦 合过程的关键驱动机制。 Biological Conservation (2015, 2018, 2021a), Conservation Letters (2018) Biological Conservation ( 2021b), Biodiversity and Conservation (2021) 分析动物群落对人类活动和其他环境变化复杂的 时空响应机制，用数据支持群落和生态系统尺度 的保护管理。 Nature (2021), Diversity and Distributions (2018) 方向2：群落尺度多样性维持机制 种群 耦合系统 群落 野外基地 秦岭、岷山、邛崃山、大凉山等 区域建立了野外实验基地。 科研产出 Nature, Conservation Letters, Diversity and Distributions, Biological Conservation等期刊论文。 研究应用 改变多个保护区规划、监测和管 理方案，支持国家公园规划建设。 人类主导景观中的生物多样性格局及维持机制 野外调查 生态建模 数据整合分析  大尺度生物多样性分布格局  生境片段化对生物多样性影响  森林生态学过程与机制 聚焦前沿 在Trends in Ecology & Evolution, Biological Reviews, Frontiers in Ecology and the Environment, Conservation Letters, Conservation Boilogy, Journal of Ecology等杂志发表系列论文。 鸟类生态学与保护生物学 栖息地生态 个体行为 迁徙生态 种群动态 群落结构 鸟类对环境变化的响应及适应性 Conservation Biology 2022 Conservation Biology 2022 Diversity and Distribution 2021 Conservation Biology 2019 Journal of Applied Ecology 2016 代表性成果 III. 生态系统与全球变化生态学 植物与土壤碳循环对气候变化的响应与适应 气候变化 影响 反馈 植物与土壤碳动态 陆地碳循环是限制人类预测未来气候最为 关键的不确定性 (IPCC, 2013) 提高模型的预测能力 在Nature Climate Change, Advanced Science, Nature Communications等期 刊发表系列论文，多篇论 文被F1000推荐，被重要 评述杂志做为案例介绍 Nat Commun, 2020 Glob Chang Bio, 2021 Sci Bull, 2021 土壤生态学：全球变化影响下地上-地下生物多样性联系及生态系统过程 在Ecology Letters, Ecology, New Phytologist, Functional Ecology, Journal Applied Ecology等期刊发表系 列论文，论文入选ESI高被引论文或 F1000推介。获国家自然科学重点基 金等项目资助。 海岸带生态学：滨海湿地退化与修复的关键生态过程 海岸带生态系统健康、稳定关系到人类社会的 可持续发展，但全球海岸带退化严峻 识别退化机制 调控制约因子 干扰后生态系统恢复存在多种可能性 恢复生态功能 在Current Biology、 Philosophical Transactions B、 Ecology等发表系列论 文，被美国科学基金会 等国际科技组织推介， 被Science等重要国际 学术期刊引用。 Curr Biol 2019 Ecology 2019 Phil Trans Roy Soc B 2020 生态遥感, 生态学大数据与公民科学 GC3S： Global Change，Eco-System, Remote Sensing, Geo-information System (GC3S) Lab。利用环境遥感和地理信息系统技术探讨全球变化背 景下的生态学问题，而这些问题目前成为大数据生态学的重要组成部分  滨海/河口湿地生态系统碳收支  人类活动、全球变化与生态系统维持  生态学大数据分析与预测  环境传感设备开发与自组网观测  生态学科普与公民科学开发 生态遥感与景观生态学：生态系统结构与功能的格局、动态与驱动因素 多源遥感数据 生态系统模型 大数据云处理平台 + + 多尺度探讨我国多种生态系统的格局与生态系统碳循环功能的动态及驱动因素 Nat Commun, 2020 Environ Res Lett, 2019 Remote Sens Environ, 2019 在Nature Communications, Remote Sensing of Environment, Environmental Research Letters等期刊发表系列论 文揭示生态系统的结构、 功能的格局、动态与驱动 因素，多篇论文是WOS 高 被引论文 生态学科招生教师及其主要研究方向 姓名 职称 研究方向 联系方式 傅萃长 贺 强 鞠瑞亭 李 博 李霖锋 马志军 聂 明 潘晓云 宋志平 吴纪华 杨 继 张文驹 赵 斌 高明君 胡俊韬 刘佳佳 王 放 黄建勋 马 俊 南 蓬 王玉国 殷明波 王莹 教授 研究员 (PI) 教授 教授 (PI) 教授 (PI) 教授 (PI) 教授 (PI) 教授 教授 教授 (PI) 教授 (PI) 教授 教授 (PI) 青年研究员 青年研究员 青年研究员 青年研究员 副研究员 副研究员 副教授 副教授 副教授 青年副研究员 鱼类系统发育与进化生物学 海岸带生态学 昆虫生态学,入侵生态学,有害生物防控 入侵生态学, 生态系统生态学,盐沼生态学 生态与进化基因组学 鸟类生态学,保护生物学 生态系统生态学 入侵生态学,群落生态学 植物分子生态学 土壤生态学,生态系统生态学 进化发育生物学, 进化基因组学 进化生态学,系统与进化生物学 生态遥感, 生态学大数据与公民科学 植物免疫与环境应答 动物分子与进化生态学 生物多样性,生境片段化, 城市生态学 种群生态学,保护生物学 基因家族进化与功能, 基因复制与物种进化 景观生态学,生态遥感, 土地利用变化 植物资源学, 生物信息学 基因组学,进化生态学,生物信息学 进化生态学 转基因生物安全与生态物种形成 czfu@fudan.edu.cn 详细介绍见：http://ecology.fudan.edu.cn qhe@fudan.edu.cn jurt@fudan.edu.cn bool@fudan.edu.cn lilinfeng@fudan.edu.cn zhijunm@fudan.edu.cn mnie@fudan.edu.cn xypan@fudan.edu.cn songzp@fudan.edu.cn jihuawu@fudan.edu.cn jiyang@fudan.edu.cn wjzhang@fudan.edu.cn zhaobin@fudan.edu.cn mjgao@fudan.edu.cn jhu@hsph.harvard.edu liujiajia@fudan.edu.cn wfang@fudan.edu.cn huang_ch@fudan.edu.cn ma_jun@fudan.edu.cn nanpeng@fudan.edu.cn wangyg@fudan.edu.cn yinm@fudan.edu.cn wang_y@fudan.edu.cn