化学文摘培训课件.pdf
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CAS 世界上化学信息的权威 陈金玲 SciFinder Web的使用介绍 CAS中国代表处 ACS Proprietary and Confidential 提纲 1 介绍 1.1 SciFinder Web中的内容 2 SciFinder Web中的检索和后处理 2.1 SciFinder Web中的文献记录及文献检索 2.2 SciFinder Web中的物质记录及物质检索 2.3 SciFinder Web中的反应记录及反应检索 3 SciFinder Web的注册 ACS Proprietary and Confidential 2 美国化学文摘社—Chemical Abstract Service ACS的分支机构，创立于1907年 总部位于俄亥俄州的哥伦布市 致力于跟踪、索引并提炼全球化 学相关的科技文献信息 最先创立了纸本《化学文摘》 Chemical Abstracts TM 1300名员工，精通50多种语言。 关注索引上万种期刊和63家专利 客户覆盖全球1900所高校、500 强公司以及所有主要的专利局。 ACS Proprietary and Confidential 3 SciFinder的覆盖内容 CAS REGISTRYSM • >8900万有机无机物质 • >6500万生物序列 • >4亿条实验和预测数据 • 物质报道文献，回溯到1802年 • 每天更新 Markush Structures • >100万专利中的Markush结构 • 回溯到1961年 • 每天更新 References SciFinder CHEMLIST® • 全球范围内的法规信息 • >30.8万的化合物 • 1980至今的数据 • 每周更新 References from CAplusSM • >3900万期刊，专利，学位论文记录. • >1万种科技期刊的覆盖 • 63家专利发行机构的专利 • 1997年以来的3.65亿条引文记录 • 回溯到1800年 • 每天更新 References from MEDLINE® • > 1900万条生命科学相关文献 • > 5600 期刊 • 回溯到1946年 • 每天更新 Reactions CASREACT® • CAS提供的反应信息包含: – 反应中的结构信息 – 反应中所有物质的CAS No – 详细的反应条件 – 实验过程 • >6050万单步多步反应 • >1340万物质合成制备信息 • 反应回溯到 1840 • 反应条件起始于 2003 • 每天更新 CHEMCATS® • CHEMCATS 提供物质的供应商信息 • >6500万商业信息 • >2100万不同种类物质 • >870 个全球范围内的供应机构 • >1,005 商品目录的覆盖 • 每周更新 ACS Proprietary and Confidential 4 提纲 1 介绍 1.1 SciFinder Web中的内容 2 SciFinder Web中的检索和后处理 2.1 SciFinder Web中的文献记录及文献检索 2.2 SciFinder Web中的物质记录及物质检索 2.3 SciFinder Web中的反应记录及反应检索 3 SciFinder Web的注册 ACS Proprietary and Confidential 5 2.1.1 SciFinder Web中的文献记录及文献检索 ——SciFinder中的文献记录 一篇完整的文献界面包括： 1. 题录信息 2. 摘要信息 3. 文献中重要的概念 4. 文献中重要的物质 5. 书目信息 6. 获得文献中的物质，反应 7. 文献中的引文信息 ACS Proprietary and Confidential 6 2.1.2 SciFinder Web中的文献记录及文献检索 ——SciFinder中的文献检索方法 功能方面 – 主题检索（Research topic） – 作者名检索（Author Name） – 机构名检索（Company Name） – 文献标示符检索（Document Identified） – 专利检索（Patent） – 期刊名称检索（Journal） 检索方法推荐 – 关注某特定领域的文献——-主题检索（Research topic） – 关注某科研人员的文献——-作者名检索（Author Name） ACS Proprietary and Confidential 7 2.1.3 SciFinder Web中的文献记录及文献检索 ——主题检索(Research Topic) 主题： gold nanoparticles with modified (金纳米颗粒的改进） 文献多种检索方式： 主题词检索 作者名检索 公司名检索 文献标示符检索 杂志名检索 金纳米颗粒的改进 gold nanoparticles with modified 专利检索 输入关键词，用介词（of, with, to, in）将关 键词连接 ACS Proprietary and Confidential 8 2.1.4 主题检索的候选项 “Concept”表示做了同义词的扩展 “Closely associated with one another”表示同时出现在一个句子中 “were present anywhere in the reference” 表示同时出现在一段 话中 ACS Proprietary and Confidential 9 2.1.5 SciFinder中的文献结果排序功能 金纳米颗粒改性相关的5792篇文献 登录号、作者名、 引文排序、出版 年限、标题 点击Citing References :将被引用次数最多的文献显 示在检索结果的最前面 ACS Proprietary and Confidential 10 2.1.6 SciFinder 中的文献检索结果 Scifinder数据库提供了强大而便捷的分析筛选工具： 分析（Analyze）、限定（Refine）、学科分类（Categorize） ACS Proprietary and Confidential 11 2.1.7 SciFinder中的文献分析(Analysis) 领域内主要研究 人员，专家 文献分析方式： 作者 CAS号 CA学科分类 公司-机构 数据库来源 文献类型 关键词 CA学科方向 期刊 文献语言 发表年限 附加索引条目 ACS Proprietary and Confidential 主要研究机构，合作 伙伴，竞争对手 中国科学院 西南大学 南京大学 湖南大学 12 2.1.7 SciFinder中的文献分析(Analysis) 索引词（Index Term）：文献中 出现了哪些重要概念？ 文献分析方式： 作者 CAS号 CA学科分类 公司-机构 数据库来源 文献类型 关键词 CA学科方向 期刊 文献语言 发表年限 附加索引条目 纳米颗粒 表面处理 化学修饰电极 电极 生物传感器 选择感兴趣的内容，点击 Apply 主要出版杂志，机构， 潜在投稿期刊 生物传感器与生物电子 发明专利申请 如果想查看完整的分析结果，点击右下端的show more。 ACS Proprietary and Confidential 13 2.1.8 SciFinder中的限定功能(Refine) Refine ：帮助用户迅速获得需要的文献 中科院 限定国内的研究机构， 竞争对手or合作伙伴or 深造的选择？ ACS Proprietary and Confidential 14 2.1.9 SciFinder 中的系统分类(Categorize) Categorize系统分类功能，基于Index Term，对文献依学科方向进行分类 ACS Proprietary and Confidential 15 2.1.9 SciFinder 中的系统分类(Categorize) 一级学科 分类标题： 工艺 基础化学 分析化学 物理化学 生物技术 基因和蛋白 和二级学科相关的关 二级学科 键词（Index Term） 选中的Index Term 物理化学 热稳定性 热力学 ACS Proprietary and Confidential 16 2.1.10 结果集的保存 Export（导出）： Citation manager: 保存成RIS格式， 用于导入EndNote等文献管理工具 Offline Review:保存成PDF，RTF格 式，用于脱机浏览 Save： 保存在服务器上，可登陆后查看 ACS Proprietary and Confidential 17 练习 检索和转基因食品安全评估的文献，获得近5年的综述文献 检索策略： – Topic Search：Genetically Modified Food with safety – Refine publish year: 2010– Refine document type: Review ACS Proprietary and Confidential 18 提纲 1 介绍 1.1 SciFinder Web中的内容 2 SciFinder Web中的检索和后处理 2.1 SciFinder Web中的文献记录及文献检索 2.2 SciFinder Web中的物质记录及物质检索 2.3 SciFinder Web中的反应记录及反应检索 3 SciFinder Web的注册 ACS Proprietary and Confidential 19 2.2.1 SciFinder中的物质检索界面 青蒿素 一个完整的物质结果界面包含： 物质详情链接 文献链接 反应链接 商品信息链接 管制品信息链接 谱图链接 实验数据链接 ACS Proprietary and Confidential 20 2.2.2 Substance Detail—物质详细信息 结构式、CAS登记号、分子 式、化学名、物理性质、别名 ACS Proprietary and Confidential 21 2.2.2 Substance Detail—物质详细信息 实验数据 实验谱图 预测数据 预测谱图 管制信息 生物活性 靶点活性 文献按CAS登记号分类 其他详细信息 ACS Proprietary and Confidential 22 2.2.2 Substance Detail—物质详细信息 实验数据 ACS Proprietary and Confidential 23 2.2.2 Substance Detail—物质详细信息 ACS Proprietary and Confidential 24 2.2.2 Substance Detail—物质详细信息 预测数据 ACS Proprietary and Confidential 25 2.2.2 Substance Detail—物质详细信息 按照CAS角色分类的专利非专利文献列表 ACS Proprietary and Confidential 26 2.2.3 物质有关的文献信息 一键获得文献，可以获得全部，也 可以勾选特别感兴趣的内容，不勾 选，默认获得全部 ACS Proprietary and Confidential 27 2.2.4 物质有关的反应 产物 反应物 反应试剂 反应物或反应试剂 催化剂 溶剂 任意角色 ACS Proprietary and Confidential 28 2.2.5 物质有关的商业来源 可以直接Export到Excel中，又或者使用 分析工具，对商业信息进行处理 ACS Proprietary and Confidential 29 2.2.6 SciFinder中的物质检索方法 检索方式 – 物质名称检索（Substance Identifier） – 分子式检索（Molecular Formula） – 结构式检索（Chemical Structure） – 理化性质检索（Property） 推荐的物质检索方法 – 有机物，天然产物及衍生物 – 无机物 – 高分子化合物 ---结构比较方便 ---分子式比较方便 ---首先分子式，其次结构 ACS Proprietary and Confidential 30 2.2.7 物质名称检索（Substance Identifier） 直接输入物质的名称，CAS No，俗名，都能检索，一 次最多检索25个物质，用换行换开 ACS Proprietary and Confidential 31 2.2.8 理化性质检索 ACS Proprietary and Confidential 32 2.2.9 分子式检索（Molecular Formula） SciFinder中的分子式的检索，需要按照HILL排序方式输入， 简单来说，CH写前面，其他的按照字母顺序写 ACS Proprietary and Confidential 33 2.2.10 结构式检索 SciFinder 中多种物质结构检索 方式，符合不同的需要 精确结构 亚结构 相似结构 ACS Proprietary and Confidential 34 结构检索分类 精选结构检索： 与已绘画的化学结构相同 构造异构体 互变异构(包括酮-烯醇互变异构) 配位化合物 离子化合物 原子基和离子基 含同位素的物质 单体组成之聚合物 亚结构检索 ： 与已绘画的结构完全相同 包含检索结构的多元物质，如 ： 聚合物、 化合物和盐基等 在指定位置有取代基和包含检索结构的物质 检索结构之环系为结果物质环系的一部分 相似结构检索： 与已绘画的结构完全相同 包含检索结构的多元物质，例如: 聚合物, 配合 物等 结构相似的物质，但元素成份、取代基和其位 置有所不同 结构相似的物质，但只有少部分与检索结构互 相符合 与检索结构相似，但有不同大小的环结构 ACS Proprietary and Confidential 35 2.2.11 SciFinder结构绘制工具 橡皮 铅笔 结构和反应切换功能 常用基团 元素周期表 R基团定义工具 可变基团 可变位置连接工具 重复基团工具 模版工具 碳链工具 结构检索选择 索套选择工具 选择工具 原子锁定工具 环锁定工具 镜面旋转工具 旋转工具 C原子和单键恢复工具 单双键，RS构 型，不确定键定 义工具 正电子 负电子 ACS Proprietary and Confidential 常见环，多元环工具 36 元素周期表 可变基团 常用官能团 R基团 ACS Proprietary and Confidential 37 可变位置连接工具 重复基团定义工具 环锁定工具（保证环结构 不成为别的环系的一部分） 原子锁定工具（保证原 子不发生别的取代） 可以检索到 不能检索到 ACS Proprietary and Confidential 38 导入.mol或者.cxf格式的结构 CAS登记号转换成结构 ACS Proprietary and Confidential 39 2.2.11结构检索举例——精确结构检索 2,6-双(二叔丁基膦基甲基)吡啶, CAS号：338800-13-8 ACS Proprietary and Confidential 40 结构式检索—精确检索 ACS Proprietary and Confidential 41 结构式检索—精确检索 ACS Proprietary and Confidential 42 结构式检索—精确检索 ACS Proprietary and Confidential 43 结构式检索—精确检索 精选结构检索： 与已绘画的化学结构相同 构造异构体 互变异构(包括酮-烯醇互变异构) 配位化合物 离子化合物 原子基和离子基 含同位素的物质 单体组成之聚合物 ACS Proprietary and Confidential 44 2.2.11 结构式检索—亚结构检索 检索举例——我想获得以下的一系列物质 CHO CHO N N NH N H Cl Cl N H CHO Cl N H N H Cl N N Cl CHO CHO NH Cl N O CHO Cl N H CHO Cl N H CHO 。。。。。。 ACS Proprietary and Confidential 45 亚结构检索 ACS Proprietary and Confidential 46 2.2.11 结构式检索—亚结构检索 结构定义 R=C、N、O 1-3 任意键 锁定环 用亚结构检索获得所 有的物质 ACS Proprietary and Confidential 47 2.2.11 结构式检索—亚结构检索 ACS Proprietary and Confidential 48 2.2.11 结构式检索—亚结构检索—结果 亚结构检索 ： 与已绘画的结构完全相同 包含检索结构的多元物质，例如: 聚 合物、化合物和盐基等 在指定位置有取代基和包含检索结 构的物质 检索结构之环系为结果物质环系的 一部分 ACS Proprietary and Confidential 49 练习 用结构检索二茂铁（CAS号：102-54-5） 检索策略 – 绘制两个环戊二烯 – 绘制一个铁 – 精确检索，选择配位化合物 ACS Proprietary and Confidential 50 提纲 1 介绍 1.1 SciFinder Web中的内容 2 SciFinder Web中的检索和后处理 2.1 SciFinder Web中的文献记录及主题检索 2.2 SciFinder Web中的物质结果及物质检索 2.3 SciFinder Web中的反应记录及反应检索 3 SciFinder Web的注册 ACS Proprietary and Confidential 51 2.3.1 SciFinder Web中的反应检索结果界面 1. 后处理功能 2. 分组功能 3. 排序功能 ACS Proprietary and Confidential 52 2.3.2 SciFinder中的反应定义工具 反应箭头 反应角色定义工具 反应原子标 记工具 反应位置标记工具 反应官能 团列表 ACS Proprietary and Confidential 53 2.3.3 SciFinder中的反应检索—案例 2 1 ACS Proprietary and Confidential 54 2.3.3 SciFinder中的反应检索 Allow variability only as specified: 精确检索，仅在特 定位点发生变化 Substructure:亚结构检索， 允许有更多取代情况 ACS Proprietary and Confidential 55 2.3.4 反应检索界面 ACS Proprietary and Confidential 56 2.3.5 精确反应检索结果 ACS Proprietary and Confidential 57 2.3.6 按照出处文献分类显示（ Group by Document ） 来自同一篇文献的反应都被整合到一起并集中显示 ACS Proprietary and Confidential 58 2.3.7 按照反应类型分类显示（ Group by Transformation ） 同一类反应被整合到一起并以通式结构集中显示； 仅适用于单步反应，未被分类的反应显示在结果集最后 ACS Proprietary and Confidential 59 2.3.8 按照实验步骤排序(Sort by Experimental procedure) ACS Proprietary and Confidential 60 练习 检索从硝基吡啶还原成吡啶氨的反应， 检索策略 – 分别绘制硝基吡啶和吡啶氨 – 中间绘制箭头，确定反应物和产物 ACS Proprietary and Confidential 61 提纲 1 介绍 1.1 SciFinder Web中的内容 2 SciFinder Web中的检索和后处理 2.1 SciFinder Web中的文献记录及主题检索 2.2 SciFinder Web中的物质结果及物质检索 2.3 SciFinder Web中的反应记录及反应检索 3 SciFinder Web的注册 ACS Proprietary and Confidential 62 3 SciFinder Web的注册 SciFinder Web的系统要求 Windows用户支持IE 8.x或者FireFox 2.x Mac 用户支持 Firefox 和 Safari 注册步骤： 1、在图书馆相关页面上找到SciFinder Web注册用的网址 ACS Proprietary and Confidential 63 ACS Proprietary and Confidential 外文数据库 64 点击第一次使用请注册 ACS Proprietary and Confidential 65 注册链接 ACS Proprietary and Confidential 66 开始创建SciFinder Web帐号 创建ID所用的IP不能是代理服务 器的IP 2、点击注册链接，打开注册网页，单击Next 3、输入联系信息。 4、指定用户名和密码 5、选择一个密码提示问题并给出答案。 单击注册（Register） ACS Proprietary and Confidential 67 对新ID的Email确认 6、登陆邮箱确认 7、系统显示注册成功确认页面 ACS Proprietary and Confidential 68 设置用户名及密码注意事项 用户名： 必须是唯一的，且包含 5-15 个字符。它可以只包含字母或字母组合、数字和/或以 下特殊字符： -（破折号） _（下划线) . （句点） @（表示“at”的符号） 密码： 必须包含 7-15 个字符，并且至少包含三种以下字符： 字母 混合的大小写字母 数字 非字母数字的字符（例如 @、#、%、&、*） 密码设置小技巧： 1：不要和账号中有重复的字符 2：密码格式最好是abc@123 ACS Proprietary and Confidential 69 SciFinder Web的登陆 SciFinder检索入口 ACS Proprietary and Confidential 70 SciFinder登陆界面 http://Scifinder.cas.org 输入SciFinder帐号和 密码 ACS Proprietary and Confidential 71 SciFinder Web 常见问题 账号或密码错误，与图书馆老师联系，或直接联系我 ACS Proprietary and Confidential 72 SciFinder Web 常见问题 并发用户数已满，请稍后再试 ACS Proprietary and Confidential 73 SciFinder Web 常见问题 任何需要反馈给图书馆的问题，都请点击测试IP地址的链接 http://www.cas.org/cgi-bin/casip 将页面截图下来，一并发给图书馆老师 并抄送给我 ACS Proprietary and Confidential 74 SciFinder Web使用注意事项 1. 2. 3. 禁止过量下载 严禁账号分享 严禁将账号用于非学术研究 ACS Proprietary and Confidential 75 Thank You! 陈金玲 SciFinder Web的使用介绍 CAS中国代表处/广州 020-83274076-604 QQ:1025585750 Mandy@igroup.com.cn www.cas.org ACS Proprietary and Confidential 76